Philipp Marguerre studierte Klavier an der Hochschule für Musik und Darstellende Kunst Mannheim in der Klavierklasse von Andreas Pistorius. Der Preisträger zahlreicher Wettbewerbe (u. a. Karl-Lang-Wettbewerb, Jugend musiziert) besuchte Meisterkurse des Mozarteums Salzburg in der Klasse von Anthony Paratore, in Radolfzell bei Klaus Schilde sowie in Plauen in der Klasse von Andreas Pistorius. Seit 2010 konzertiert Philipp Marguerre als Pianist und Liedbegleiter, u. a. regelmäßig mit dem Deutschen Filmorchester Babelsberg.
2002 wurde Philipp Marguerre Mitglied des Glasmusikensembles sinfonia di vetro. Seither tritt er weltweit als Glasinstrumentenmusiker im Konzertbereich und als Opernsolist in Erscheinung. Er spielt exklusiv die von Sascha Reckert entwickelten Glasinstrumente, insbesondere das Verrophon. Seine Auftritte als Solist führten ihn u. a. an die Dresdner Semperoper, das Royal Opera House, die Deutsche Oper Berlin, die Mailänder Scala, das San Francisco Opera House, das Teatro Real Madrid (jeweils mit Natalie Dessay) und die Wiener Staatsoper (mit Anna Netrebko) sowie zu den Salzburger Festspielen.
Philipp Marguerres besonderes Interesse gilt der Verwendung von Glasinstrumenten im Bereich der Frühklassik und Romantik. Dank seiner Forschungen konnte sinfonia di vetro zu Unrecht vergessene Werke wiederaufführen und so das Repertoire der seltenen Glasinstrumente umfassend erweitern. 2006 gründete er den Noten-Verlag Inter-Note und verlegt u. a. die Originalliteratur für historische und moderne Glasinstrumente.
Seine theoretischen und praktischen Fähigkeiten sowie seine Freude am Improvisieren sind vielfältig. Musikensembles und Komponisten arbeiten kontinuierlich mit ihm zusammen. Daraus entstehen langjährige Kooperationen wie mit Garry Eister, dessen Werke er uraufführte und für dessen CD-Einspielung "Traveling in Rain" er die Glasinstrumentenparts einspielte oder auch das seit 2012 andauernde Engagement für den Verrophonpart in George Benjamins Oper "Written on Skin".